螺杆空压机的冷却系统结垢将引起空压机故障。冷却系统结垢，使冷却水不能有效地与气缸进行换热，导致气缸运行温度升高而引发事故。据调查，造成空压机冷却效果不好的原因，一是冷却系统的结构存在着设计制造的缺陷；二是冷却水质差，硬度高且存在杂质，结垢也是不可避免的。这是因为冷却水在运行过程中，当经过换热器时，重碳酸根分解失去平衡，碳酸根离子浓度增加，与水中钙离子生成碳酸钙。碳酸钙的溶解度较低，在设备受热表面沉积，形成水垢。

由于水垢的导热系数低（仅为钢材的4.0%左右），随着垢层的加厚，冷却水管的水流通径变小，造成螺杆空压机冷却水与气缸体之间的换热效率大大降低，进一步加剧垢层的生长。而空压机冷却系统一旦结垢将会严重威胁空压机的安全运行，首先，垢层部分会形成贫氧区，与冷却系统中的金属产生氧浓差电池效应，引起电化学腐蚀；其次，垢层内部造成嫌氧条件，给硫酸盐还原菌创造生长条件，并加速垢层的生长。垢层的存在将影响空压机效率的提高，造成空压机能耗的增加，严重者将引起空压机着火、爆炸等重大事故，造成人员伤亡及巨大经济损失。